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Tropolink : application web de gestion et d'analyse des calculs de trajectoires des masses d'air

23/06/2023 | Data Science | Django | Python

Le projet Tropolink est né du besoin de disposer d’outils pour suivre des populations de petits organismes biologiques ou des épidémies proliférant dans le monde végétal. En effet, la dispersion par l’air sur de longues distances, généralement supérieure à 10 km, constitue un processus de premier ordre en ce qui concerne le développement de ces organismes à grande échelle : bactéries, champignons, pucerons, etc.

Ce projet regroupe des chercheurs de diverses disciplines - sciences de la vie, mathématiques, informatique, sciences sociales et économiques - et participera à terme à une meilleure :

  • Gestion des cultures : arboriculture, maraîchage, vigne, etc.
  • Surveillance des agents invasifs : champignons, bactéries, virus, etc.
  • Connaissance des voies de dissémination : vection par insectes (sensation de mouvement du corps par rapport à son environnement), échanges commerciaux, etc.
  • Prévision des épidémies

Techniquement parlant, Tropolink estime des matrices de connectivités générées par le mouvement des masses d’air troposphériques pour des réseaux de sites géographiques. Les résultats sont accessibles aux utilisateurs dans des Notebooks Jupyter, leur permettant ainsi une analyse exploratoire et personnalisable.

La presse en parle

Découvrez l'article scientifique en lien avec le projet Tropolink paru dans Advancing Earth and Space Sciences, GeoHealth :

INRAE

INRAE, l’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement propose par la recherche, l’innovation et l’appui aux politiques publiques de nouvelles orientations pour accompagner l’émergence de systèmes agricoles et alimentaires durables. L'INRAE ambitionne d’apporter des solutions pour la vie, les humains et la terre.

Projet : Tropolink - Un projet Autonomens


Challenge

  • Architecture complexe
  • Utilisation d'un cluster de calcul externe
  • Interfaçage de Notebooks Jupyter avec une API Django

Solution

  • Réalisation d’un POC / preuve de concept en phase de conception
  • Réalisation d'une application en React et Django afin de
    • lancer les calculs sur une grappe de serveurs externes
    • mettre à jour en temps réel leurs avancements
    • puis de télécharger les résultats et/ou les analyser directement en ligne à travers un Notebook Jupyter
  • Authentification par Keycloak, aussi bien dans l'application que dans le Notebook Jupyter, pour la gestion des utilisateurs et groupes d'utilisateurs avancés

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